Система раздельного обучения призвана проводить обучение мальчиков и девочек автономно друг от друга. При такой методике обучения разнополые ученики учатся в обособленных учебных подразделениях, а иногда в отдельных заведениях.
Как правило, имеется в виду среднее образование и раздельное обучение мальчиков и девочек в разрозненных классах, и первым долгом - в разных учреждениях. Как следствие - существуют мужские и женские школы, интернаты, пансионы и другие заведения, рассчитанные обучать детей одного пола. По этому поводу имеются аргументы, как в поддержку такой практики обучения, так и против нее.
Раздельное обучение имело место в разные периоды и даже сейчас существует во многих странах. Особенно популярной данная практика была на заре XX века.